消化科是南京市临床重点专科建设单位，目前含门诊、病区及消化内镜中心。有主任医师1名、副主任医师1名、主治医师1名、住院医师4名，博士研究生1名，硕士研究生4名。配备日本电子胃镜6台套、电子结肠镜3台套、电子十二指肠镜1台套，幽门螺杆菌检测仪及其多种辅助治疗器械。专设的内镜洗消工作站能确保内镜和辅助器械的消毒达标。 医院大力扶持消化内镜下微创手术的创新及发展。先后多次派出科内人员至江苏省人民医院、南京鼓楼医院、江苏省中医院、南京市第一医院进修学习。我科与江苏省人民医院深度合作，并被授牌为江苏省消化和消化内镜适宜技术孵化基地。在高淳地区较早开展内镜下NBI电子染色诊断胃肠道癌前病变及早期肿瘤。目前常规能行消化道早期肿瘤内镜下黏膜切除（EMR）及黏膜下剥离术（ESD）；内镜下逆行胰胆管造影（ERCP）；超声内镜检查（EUS）；内镜下鼻胆管、鼻胰管引流；内镜下胆总管取石；内镜下胆管狭窄支架置入术；内镜下金属夹止血；内镜下尼龙绳结扎、电凝电切、APC喷灼、钛夹缝合联合应用摘除消化道大息肉及宽蒂息肉；疣状胃炎射频和氩离子热凝固治疗；内镜下套扎及硬化剂治疗食管静脉曲张；消化道异物内镜下取出术；内镜下消化道狭窄扩张术；内镜下消化道支架植入术；B超引导下肝肾囊肿穿刺术；内痔的内镜下套扎治疗术。